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新城疫病毒(NCV)熒光定量RT-PCR檢測試劑盒

點擊次數(shù):1340 更新時間:2011-09-16
 

新城疫病毒(NCV)熒光定量RT-PCR檢測試劑盒說明書
用途: 新城疫病毒的RT-PCR體外分型檢測
檢測原理:試劑盒中含有新城疫病毒基因特異性引物和探針,當(dāng)樣品中含有新城疫病毒時,提取新城疫病毒RNA通過逆轉(zhuǎn)錄和PCR反應(yīng)成指數(shù)擴(kuò)增,在反應(yīng)過程中新城疫病毒的特異熒光探針跟靶核酸雜交, 同時被Taq酶水解, 把探針上的熒光基團(tuán)和淬滅基團(tuán)分開而產(chǎn)生熒光, 探針采用Fam熒光基團(tuán)標(biāo)記,從而通過其熒光增量來實時判斷新城疫病毒的存在。
技術(shù)參數(shù):1. 符合SN/T 1686-2005《新城疫病毒中強(qiáng)毒株檢測方法:熒光RT-PCR法》的檢測要求,可用于禽肉、禽類組織臟器、禽類排泄和分泌物,及其泄殖腔和咽喉拭樣中新城疫病毒的檢測。
2. 靈敏度:對于接種的雞胚尿囊液,檢測的zui高稀釋度可達(dá)10-8~10-7,與雞胚病毒分離方法的靈敏度接近。定量檢測線性范圍可達(dá)10-1010拷貝/ml。
3. 特異性:采用基因序列數(shù)據(jù)庫設(shè)計,并通過系統(tǒng)驗證,新城疫病毒RT-PCR能夠檢測所有已知新城疫病毒毒株。對于其它禽類感染因子,本試劑盒檢測結(jié)果為陰性。
產(chǎn)品盒組成:(不包括新城疫病毒RNA提取試劑,用戶可采用通用型病毒RNA提取試劑盒或試劑盒推薦的提取方法。)
適用儀器:ABI7500,9600系列,MJ opticon2,Bio-Rad等熒光定量PCR儀均可。
實驗方法:1. 用戶可采用通用型病毒RNA提取試劑盒提取新城疫病毒RNA用于檢測或保存于-20℃以待檢測。
2. 將RT-PCR一步法反應(yīng)液置室溫平衡,融化后取Taq HS酶和逆轉(zhuǎn)錄酶(使用前2000rpm離心10sec),按2.5U/管加入Taq HS酶,5.0U/管加入逆轉(zhuǎn)錄酶,即每個測試反應(yīng)體系配制為: RT-PCR反應(yīng)液18.5ul+0.5ul Taq HS酶+1ul逆轉(zhuǎn)錄酶。
3. 加入模板:若樣本提取物保存在-20℃,則在使用前置室溫解凍;陰、陽性對照使用前置室溫解凍。在每個PCR反應(yīng)管中分別加入模板或陰、陽性對照各5μl,蓋好管蓋,置于PCR儀上,記錄相應(yīng)的樣品號。
4. 循環(huán)條件設(shè)置:
熒光RT-PCR的反應(yīng)參數(shù)為:
—— *階段,反轉(zhuǎn)錄 50℃/30 min;
—— 第二階段,預(yù)變性 94℃/2 min;
—— 第三階段,94℃/5 s,60℃/40 s,40 個循環(huán),熒光收集設(shè)置在第三階段每次循環(huán)的退火延伸區(qū)。信號采集設(shè)為Fam熒光素。反應(yīng)體系設(shè)為25μl。
結(jié)果分析:對于MJ Opticon2系列熒光定量PCR檢測儀進(jìn)行結(jié)果分析時,扣除本底后再輸入1-15之間的熒光值,進(jìn)行Ct值的設(shè)置或拖動基線到合適的位置以確定ct值。
對于ABI7500,9600系列熒光PCR檢測儀進(jìn)行結(jié)果分析時基線的確定:取3-10或3-15個循環(huán)的熒光值,閾值設(shè)定原則為閾值線剛好超過正常陰性對照品擴(kuò)增曲線的zui高點,而不顯示Ct值為宜。
質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn):陰性對照無Ct值顯示或Ct值為40,陽性對照的Ct值≤30.0,否則為實驗失敗。
結(jié)果判斷:1. 檢測樣本Ct值≤35.0時,報告陽性。
2.檢測樣本Ct值>35.0且Ct值<40時,需重復(fù)檢測一次,如果Ct值仍<40,但曲線有明顯的對數(shù)增長特性,報告本陽性,否則報告陰性。
3.樣本不顯示Ct值時,報告陰性。
試劑盒使用注意事項:1. 本試劑盒僅用于體外檢測等研究用途,開始使用前請仔細(xì)閱讀本說明書全文。
2.實驗必須嚴(yán)格分區(qū)操作:PCR前準(zhǔn)備區(qū)——準(zhǔn)備實驗試劑;樣本處理區(qū)——待測樣本、模板處理區(qū);檢測區(qū)——PCR擴(kuò)增檢測。
3.所用的吸頭和離心管都需要經(jīng)DEPC水處理,以滅活RNA酶,75%乙醇也要用DEPC處理過的水配制。
4.試劑盒中各試劑充分融化后請短暫離心。反應(yīng)液分裝時應(yīng)盡量避免產(chǎn)生氣泡。上機(jī)前應(yīng)注意檢查各反應(yīng)管是否蓋緊,以免污染儀器。
5.有關(guān)實驗室管理規(guī)范請參照國家相關(guān)部門頒布的基因擴(kuò)增實驗室的管理規(guī)范執(zhí)行。

 

 
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